Тогда проследите, не стал ли кот ходить в лоточек кошечки. Наполнитель в лоточках желательно обновить. Тряпочкой или салфеткой собрать кошкины "творчества" и покапать в ее лоточек. После этого поднесите кошку к лоточку и дайте ей понюхать. Возможно, у кошки это от стресса, что кот где-то совсем рядом... У меня после об'единения котов, кошка практически(на какое-то время) вообще перестаала ходить в туалет, а котенок вместо лоточка стал гадить в ванну и раковину. Снова к лотку приучала поощрениями - за каждый поход в лоточек котенок получает лакомство, до сих пор. У кошечки тоже все наладилось.
Побольше гладьте обоих, разговаривайте с ними мягкими доброжелательными интонациями. Можете попробовать методику поощрения, как в моем случае